【摘要】右視圖與左視圖對稱，省略右視圖?！緦＠愋汀客庥^設計【申請人】何銘權【申請人類型】個人【申請人地址】201100上海市淡水路89弄11號【申請人地區(qū)】中國【申請人城市】上海市【申請人區(qū)縣】閔行區(qū)【申請?zhí)枴緾N200630137289
【摘要】 本發(fā)明涉及一種計算機應用技術領域的交叉反 應抗原計算機輔助篩選的方法。本發(fā)明建立病原微生物和人特 異組織細胞的蛋白質數(shù)據(jù)集，然后通過局部序列比對算法，得 到給定長度的相似子序列對；建立B細胞線性表位和非線性表 位的數(shù)據(jù)集，特征提取，用于支持向量機(SVM)的學習訓練， 將訓練好的SVM預測相似子序列的B細胞線性表位的可能性， 根據(jù)B細胞線性表位的可能性大小篩選出可能性較大的相似 子序列。本發(fā)明是傳統(tǒng)免疫學實驗方法篩選交叉抗原的重要補 充，通過向實驗免疫學家提供候選交叉反應抗原，大大減少了 他們的實驗工作量，為傳統(tǒng)免疫學實驗方法失敗時提供了又一 解決思路。 【專利類型】發(fā)明申請 【申請人】上海交通大學 【申請人類型】學校 【申請人地址】200240上海市閔行區(qū)東川路800號 【申請人地區(qū)】中國 【申請人城市】上海市 【申請人區(qū)縣】閔行區(qū) 【申請?zhí)枴緾N200610029136.0 【申請日】2006-07-20 【申請年份】2006 【公開公告號】CN1889086A 【公開公告日】2007-01-03 【公開公告年份】2007 【授權公告號】CN100428254C 【授權公告日】2008-10-22 【授權公告年份】2008.0 【IPC分類號】G06F19/00 【發(fā)明人】陳軍; 楊杰; 劉蕙 【主權項內容】1、一種交叉反應抗原計算機輔助篩選的方法，其特征在于，建立病原微生 物和人特異組織細胞的蛋白質數(shù)據(jù)集，然后通過局部序列比對算法，得到給定長 度的相似子序列對，建立B細胞線性表位和非線性表位的數(shù)據(jù)集，特征提取， 用于支持向量機SVM的學習訓練，將訓練好的SVM檢測相似子序列的B細胞 線性表位的可能性，根據(jù)B細胞線性表位的可能性大小篩選出可能性較大的相 似子序列。 【當前權利人】上海交通大學 【當前專利權人地址】上海市閔行區(qū)東川路800號 【統(tǒng)一社會信用代碼】1210000042500615X0 【被引證次數(shù)】7 【被自引次數(shù)】4.0 【被他引次數(shù)】3.0 【家族引證次數(shù)】5.0 【家族被引證次數(shù)】7
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