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【摘要】 本發(fā)明公開了一種驗(yàn)證性篩選目的結(jié)構(gòu)域結(jié)合配體的方法。該方法包括以下步驟：1)以目的結(jié)構(gòu)域家族中結(jié)合特性有代表性的成員為誘餌蛋白篩選酵母雙雜交文庫；2)收集步驟1)篩選獲得的結(jié)合配體克隆以及其它已知或可能的目 的結(jié)構(gòu)域結(jié)合配體克隆，得到目的結(jié)構(gòu)域結(jié)合配體文庫；3)以該結(jié)構(gòu)域家族中的其它成員或步驟1)中的成員為誘餌蛋白，用酵母雙雜交系統(tǒng)驗(yàn)證性篩選步驟2)構(gòu)建的結(jié)合配體文庫，得到目的結(jié)構(gòu)域的陽性和陰性結(jié)合配體；4)分析步驟1)和/或步驟3)篩選得到的目的結(jié)構(gòu)域的陽性和陰性結(jié)合序列，總結(jié)結(jié)合特性和共有結(jié)合序列；5)預(yù)測(cè)目的結(jié)構(gòu)域的配體蛋白；6)驗(yàn)證預(yù)測(cè)的相互作用，得到與目的結(jié)構(gòu)域相互作用的配體蛋白。。 【專利類型】發(fā)明申請(qǐng) 【申請(qǐng)人】中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所 【申請(qǐng)人類型】科研單位 【申請(qǐng)人地址】100005北京市東單3條5號(hào) 【申請(qǐng)人地區(qū)】中國 【申請(qǐng)人城市】北京市 【申請(qǐng)人區(qū)縣】東城區(qū) 【申請(qǐng)?zhí)枴緾N200610057182.1 【申請(qǐng)日】2006-03-13 【申請(qǐng)年份】2006 【公開公告號(hào)】CN101037707A 【公開公告日】2007-09-19 【公開公告年份】2007 【授權(quán)公告號(hào)】CN101037707B 【授權(quán)公告日】2012-08-22 【授權(quán)公告年份】2012.0 【IPC分類號(hào)】C12Q1/68; G01N33/68 【發(fā)明人】高友鶴; 宋婀莉; 高詩娟; 田瑞; 馬素參; 黃海明 【主權(quán)項(xiàng)內(nèi)容】1、一種驗(yàn)證性篩選目的結(jié)構(gòu)域結(jié)合配體的方法，包括以下步驟： 1)用酵母雙雜交系統(tǒng)，以目的結(jié)構(gòu)域家族中結(jié)合特性有代表性的成員為誘餌蛋 白篩選酵母雙雜交文庫，所述酵母雙雜交文庫包括隨機(jī)多肽文庫、或任一物種的細(xì)胞 或組織的基因組文庫或cDNA文庫； 2)建立目的結(jié)構(gòu)域結(jié)合配體文庫：收集步驟1)篩選獲得的結(jié)合配體克隆以及其 它已知或可能的目的結(jié)構(gòu)域結(jié)合配體克隆，得到目的結(jié)構(gòu)域結(jié)合配體文庫； 3)以該目的結(jié)構(gòu)域家族中的其它成員或所述步驟1)中的結(jié)構(gòu)域成員為誘餌蛋白， 用酵母雙雜交系統(tǒng)驗(yàn)證性篩選步驟2)構(gòu)建的結(jié)合配體文庫，得到目的結(jié)構(gòu)域的陽性 和陰性結(jié)合配體； 4)對(duì)步驟1)和/或步驟3)中篩選得到的每個(gè)目的結(jié)構(gòu)域的陽性結(jié)合配體序列 和陰性結(jié)合配體序列進(jìn)行序列分析，總結(jié)每個(gè)目的結(jié)構(gòu)域的結(jié)合特性，推測(cè)其共有結(jié) 合序列； 5)用步驟4)中推測(cè)的共有結(jié)合序列檢索蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫，預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中所 有可能與目的結(jié)構(gòu)域結(jié)合的配體蛋白；再根據(jù)蛋白質(zhì)的生物學(xué)信息，進(jìn)一步預(yù)測(cè)最有 可能的目的結(jié)構(gòu)域的配體蛋白； 6)用常規(guī)的鑒定蛋白質(zhì)相互作用的方法驗(yàn)證步驟5)預(yù)測(cè)的目的結(jié)構(gòu)域結(jié)合配體 蛋白，得到與目的結(jié)構(gòu)域相互作用的配體蛋白。 【當(dāng)前權(quán)利人】中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所 【當(dāng)前專利權(quán)人地址】北京市東單3條5號(hào) 【統(tǒng)一社會(huì)信用代碼】12100000400010902X 【引證次數(shù)】1.0 【被引證次數(shù)】7 【自引次數(shù)】1.0 【被他引次數(shù)】7.0 【家族引證次數(shù)】1.0 【家族被引證次數(shù)】7

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